MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet

Total Repeats: 1180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017282	TTGT	2	8	10	17	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017282	TGT	2	6	37	42	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017282	ATT	2	6	109	114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017282	TCT	2	6	134	139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017282	T	7	7	145	151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017282	CTT	2	6	153	158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017282	TGCTT	2	10	161	170	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017282	ATCT	2	8	240	247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017282	TCT	2	6	269	274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017282	CTT	2	6	348	353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017282	A	7	7	401	407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017282	TTG	2	6	417	422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017282	CTT	2	6	447	452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017282	T	7	7	488	494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017282	TTTG	2	8	508	515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017282	TCT	2	6	524	529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017282	T	6	6	538	543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017282	CTT	2	6	567	572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017282	TCA	2	6	584	589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017282	CTA	2	6	621	626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017282	T	7	7	644	650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017282	T	6	6	694	699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017282	TTC	2	6	702	707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017282	TCA	2	6	749	754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017282	ATT	2	6	781	786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017282	AAT	2	6	795	800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017282	ACTT	2	8	813	820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017282	TAA	2	6	869	874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017282	CAT	2	6	963	968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017282	ATT	2	6	1036	1041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017282	T	6	6	1095	1100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017282	TCA	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017282	T	6	6	1174	1179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017282	A	6	6	1180	1185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017282	ATA	2	6	1187	1192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017282	GTA	2	6	1196	1201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017282	T	6	6	1219	1224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017282	ATT	2	6	1231	1236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017282	TA	3	6	1276	1281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017282	A	6	6	1310	1315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017282	TAC	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017282	AGC	2	6	1333	1338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017282	TCT	2	6	1346	1351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017282	AAT	2	6	1380	1385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017282	TTA	2	6	1400	1405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017282	GTA	2	6	1409	1414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017282	T	7	7	1433	1439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017282	AAAT	2	8	1483	1490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017282	TAT	2	6	1506	1511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017282	AT	3	6	1542	1547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017282	T	6	6	1601	1606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017282	A	6	6	1616	1621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017282	CAT	2	6	1665	1670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017282	ATA	2	6	1712	1717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017282	TAA	2	6	1788	1793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017282	TGA	2	6	1826	1831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017282	ATTT	2	8	1866	1873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017282	TCTTGT	2	12	1880	1891	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017282	GTAGC	2	10	1895	1904	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017282	T	7	7	1949	1955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017282	ATCT	2	8	1959	1966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017282	AGAT	2	8	1979	1986	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017282	TCA	2	6	1988	1993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017282	CTT	3	9	2030	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017282	CAT	2	6	2046	2051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017282	TTG	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017282	TTG	2	6	2077	2082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017282	CTT	2	6	2090	2095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017282	GCA	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017282	TCA	3	9	2117	2125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017282	ATTG	2	8	2171	2178	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017282	ATTT	2	8	2181	2188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017282	TC	3	6	2227	2232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017282	CTT	2	6	2243	2248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017282	TTTGTG	2	12	2273	2284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017282	TC	3	6	2352	2357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017282	TAT	2	6	2361	2366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017282	TGA	2	6	2413	2418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017282	GTTC	2	8	2426	2433	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017282	TTG	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017282	TCT	2	6	2489	2494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017282	T	7	7	2574	2580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017282	T	6	6	2607	2612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017282	TA	3	6	2681	2686	50 %	50 %	0 %	0 %	384442306
85	NC_017282	CTAAAT	2	12	2704	2715	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384442306
86	NC_017282	T	6	6	2723	2728	0 %	100 %	0 %	0 %	384442306
87	NC_017282	ACT	2	6	2763	2768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442306
88	NC_017282	TCT	2	6	2777	2782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442306
89	NC_017282	TTC	2	6	2803	2808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442306
90	NC_017282	T	6	6	2839	2844	0 %	100 %	0 %	0 %	384442306
91	NC_017282	T	8	8	2888	2895	0 %	100 %	0 %	0 %	384442306
92	NC_017282	ATT	3	9	2898	2906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442306
93	NC_017282	TAA	2	6	2916	2921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442307
94	NC_017282	A	6	6	2948	2953	100 %	0 %	0 %	0 %	384442307
95	NC_017282	AAG	2	6	3003	3008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442307
96	NC_017282	ACT	2	6	3013	3018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442307
97	NC_017282	TTTCTC	2	12	3106	3117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442307
98	NC_017282	ATC	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442307
99	NC_017282	AAT	3	9	3220	3228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442307
100	NC_017282	TTA	2	6	3230	3235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442307
101	NC_017282	CTTT	2	8	3236	3243	0 %	75 %	0 %	25 %	384442307
102	NC_017282	AAT	2	6	3244	3249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442307
103	NC_017282	ACC	2	6	3274	3279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384442307
104	NC_017282	T	8	8	3303	3310	0 %	100 %	0 %	0 %	384442307
105	NC_017282	A	6	6	3377	3382	100 %	0 %	0 %	0 %	384442307
106	NC_017282	ACC	2	6	3430	3435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384442307
107	NC_017282	T	6	6	3436	3441	0 %	100 %	0 %	0 %	384442307
108	NC_017282	ACA	2	6	3446	3451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442307
109	NC_017282	A	7	7	3463	3469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017282	T	6	6	3472	3477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017282	TA	3	6	3495	3500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017282	TAA	2	6	3512	3517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017282	AAAT	2	8	3525	3532	75 %	25 %	0 %	0 %	384442308
114	NC_017282	TCT	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442308
115	NC_017282	TA	3	6	3646	3651	50 %	50 %	0 %	0 %	384442308
116	NC_017282	AT	3	6	3663	3668	50 %	50 %	0 %	0 %	384442308
117	NC_017282	CAT	2	6	3670	3675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442308
118	NC_017282	TCT	2	6	3683	3688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442308
119	NC_017282	TTTA	2	8	3737	3744	25 %	75 %	0 %	0 %	384442308
120	NC_017282	TAT	3	9	3766	3774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442308
121	NC_017282	TTA	2	6	3789	3794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442309
122	NC_017282	TCT	2	6	3843	3848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442309
123	NC_017282	CTCTTT	2	12	3849	3860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442309
124	NC_017282	TCT	2	6	3868	3873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442309
125	NC_017282	T	6	6	3915	3920	0 %	100 %	0 %	0 %	384442309
126	NC_017282	ATA	2	6	3960	3965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442309
127	NC_017282	CAT	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442309
128	NC_017282	ATC	2	6	4044	4049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442309
129	NC_017282	GTT	2	6	4071	4076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442309
130	NC_017282	ATC	2	6	4095	4100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442309
131	NC_017282	CTT	2	6	4109	4114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442309
132	NC_017282	T	7	7	4123	4129	0 %	100 %	0 %	0 %	384442309
133	NC_017282	A	7	7	4170	4176	100 %	0 %	0 %	0 %	384442309
134	NC_017282	TCT	3	9	4204	4212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442309
135	NC_017282	AAC	2	6	4281	4286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442309
136	NC_017282	T	6	6	4324	4329	0 %	100 %	0 %	0 %	384442309
137	NC_017282	TAC	2	6	4338	4343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442309
138	NC_017282	TCC	2	6	4353	4358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384442310
139	NC_017282	A	6	6	4400	4405	100 %	0 %	0 %	0 %	384442310
140	NC_017282	AAC	2	6	4430	4435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442310
141	NC_017282	TCA	2	6	4485	4490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442310
142	NC_017282	TAAA	2	8	4514	4521	75 %	25 %	0 %	0 %	384442310
143	NC_017282	T	6	6	4539	4544	0 %	100 %	0 %	0 %	384442310
144	NC_017282	ATTT	2	8	4577	4584	25 %	75 %	0 %	0 %	384442310
145	NC_017282	A	6	6	4598	4603	100 %	0 %	0 %	0 %	384442310
146	NC_017282	ATA	2	6	4647	4652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442310
147	NC_017282	TAA	2	6	4723	4728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442310
148	NC_017282	ATAA	2	8	4736	4743	75 %	25 %	0 %	0 %	384442310
149	NC_017282	AGATA	2	10	4763	4772	60 %	20 %	20 %	0 %	384442310
150	NC_017282	ATC	2	6	4778	4783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442310
151	NC_017282	ACT	2	6	4790	4795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442310
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153	NC_017282	CTA	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442310
154	NC_017282	T	7	7	4849	4855	0 %	100 %	0 %	0 %	384442310
155	NC_017282	TAA	2	6	4887	4892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017282	T	6	6	4925	4930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017282	A	6	6	4956	4961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017282	GA	4	8	4991	4998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017282	A	6	6	5068	5073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017282	TAT	2	6	5079	5084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017282	A	6	6	5133	5138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_017282	T	9	9	5236	5244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017282	CTC	2	6	5260	5265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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166	NC_017282	TA	3	6	5294	5299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017282	ATT	2	6	5302	5307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017282	ATTAAA	2	12	5309	5320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_017282	AT	4	8	5333	5340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017282	TTA	2	6	5347	5352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017282	TTA	2	6	5364	5369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017282	TAG	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_017282	TTA	2	6	5614	5619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442311
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184	NC_017282	T	6	6	5716	5721	0 %	100 %	0 %	0 %	384442311
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190	NC_017282	CTGCT	2	10	5898	5907	0 %	40 %	20 %	40 %	384442311
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197	NC_017282	CTTTC	2	10	6267	6276	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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199	NC_017282	T	8	8	6396	6403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_017282	CTTT	2	8	9661	9668	0 %	75 %	0 %	25 %	384442316
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272	NC_017282	T	7	7	9723	9729	0 %	100 %	0 %	0 %	384442316
273	NC_017282	TATTT	2	10	9736	9745	20 %	80 %	0 %	0 %	384442316
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276	NC_017282	AT	3	6	9795	9800	50 %	50 %	0 %	0 %	384442316
277	NC_017282	T	6	6	9847	9852	0 %	100 %	0 %	0 %	384442316
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279	NC_017282	AATT	2	8	9917	9924	50 %	50 %	0 %	0 %	384442316
280	NC_017282	CTT	2	6	9950	9955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442316
281	NC_017282	TA	3	6	10004	10009	50 %	50 %	0 %	0 %	384442316
282	NC_017282	ATTT	2	8	10062	10069	25 %	75 %	0 %	0 %	384442316
283	NC_017282	T	6	6	10067	10072	0 %	100 %	0 %	0 %	384442316
284	NC_017282	ATA	2	6	10086	10091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442316
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286	NC_017282	ATT	2	6	10104	10109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442316
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420	NC_017282	T	8	8	14318	14325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_017282	TA	3	6	14327	14332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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